飞针疗法和毫针刺法一样，适应证极其广泛，包括内、外、妇、儿、骨伤等多科常见病、疑难杂症，大致可以分为以下几个方面。
(1)内科病症：中风、眩晕、头痛、面瘫、痹证、痿证、腰痛、胁痛、痫证、痛证、不寐、脏躁、惊悸、怔忡、感冒、咳嗽、哮喘、胃痛、呕吐、腹痛、泄泻、便秘、脱肛、癃闭、水肿、消渴、遗精、阳痿等。
(2)妇科病症：月经不调、经闭、痛经、带下、乳少等。
(3)儿科病症：小儿惊风、指积、遗尿、小儿麻痹后遗症等。
(4)外科病症：座疮、风疹、湿疹、乳癖、扭伤、落枕、丹毒等。
(5)五官科病症：目赤肿痛、脸腺炎、近视、牙痛、耳鸣、耳聋、咽喉肿痛等。
(6)急性病症：高热、昏迷、抽搐、晕厥等。
(7)其他：单纯性肥胖、疲劳综合征、神经官能症等。
