以形态命名：如牛膝，因其茎节粗而膨出，状似牛的膝关节而得名；白头翁则以其“近根处有白茸，状似白头老翁”而得名；狗脊的根上有金黄色的茸毛，酷似狗脊而得名。
以气味命名：有酸味的酸枣仁、甜味的甘草、苦味的苦参、辣味的细辛皆以味而得名；五味子因其“皮肉甘酸，核中辛苦，都有咸味”，五味俱全故而得名；鱼腥草因其叶具有鱼腥味而得名。
以颜色命名：许多中药具有天然的颜色。如红色的有红花、赤芍、丹参等；黄色的有黄柏、黄连、黄芩等；青色的有青皮、青蒿、大青叶等；白色的有白术、白芷、白芨等；紫色的有紫草、紫花地丁等。
以产地命名：如川连、川芎、川贝母等，皆因主产于四川而得名；广藿香、广皮、广木香产于广东；建曲、建泽泻产于福建；云茯苓产于云南；关防风、关黄柏产于东北地区，因而得名。还有蜀椒、杭菊、浙贝、阿胶，皆因产地而得名。
以生长特点命名：如半夏，农历五月间成熟，恰巧是夏季过一半，故得其名；夏枯草因每到夏至便萎谢而得名；忍冬藤因经冬不凋而得名；万年青因四季长青而得名；冬虫夏草因其冬为虫、夏为草，成虫体与菌座相连而得名。
以药物功效命名：防风能治诸风头痛；泽泻能泄利水湿；益母草能治妇科病；千年健能“祛风延年”；远志能益智安神强志；骨碎补能活血壮筋、续骨疗伤；孩儿参用于补益儿童气虚等。
另外，有些中药的别名也颇耐人寻味。甘草有调和诸药的功效，尤似和事的国老，故又称“国老”；大黄泻下作用猛烈，功大力专，好似勇猛无敌的将军。故也称“将军”；其他如灶心土，称“伏龙肝”，花生衣称“凤凰衣”等，也富有情趣。
